miércoles, 26 de mayo de 2010

Creyendo a medias.

Imaginaos la siguiente situación.

Una mujer sale del homeópata. Llevaba seis días con un resfriado y fue a por algunos remedios. El homeópata le da un preparado homeopático y le da una dieta que se ajusta a su grupo sanguíneo.
De camino a su casa, compra un revista y lee la sección de astrología para ver que le deparara el día. Luego lee un articulo de cómo decorar la casa para maximizar el flujo de energía positiva. A tiempo se da cuenta que casi se cruza con un gato negro, que da mala suerte, pero lo esquiva.

Cuando llega a casa se encuentra con su marido en pleno acto sexual con otra mujer.
El marido alega que el no tiene la culpa, que la otra mujer es una bruja, y que mediante un hechizo ha anulado su voluntad, convirtiéndolo en un esclavo, y obligándole a acostarse con ella.

¿Que creéis que pasaría?

A) La mujer comprensiva, se cree lo que dice su marido. Además la estructura facial de la cara de este indica que es una persona sincera y fiel.
B) Le manda a la mierda. Le dice que se prepare para una separación.



A mi siempre me ha resultado curioso como ciertas personas, realizan un filtro bastante poco riguroso a la hora de decidir que creencias irracionales se pueden aplicar en sus vidas.

Si hay fuerzas misteriosas y cósmicas que controlan nuestro futuro, pero que no tienen ni explicación científica ni evidencias...
Si las moléculas se pueden comportar de forma que la química dice que es imposible...
Si ciertas cosas con fuerzas misteriosas de las que no hay evidencia física alguna, pero que nos pueden afectar físicamente en nuestras vidas...

¿Por qué no puede haber perfectamente cosas que se puedan explicar mediante la magia?

Haced la prueba, actuad como si pensaseis que existiese la magia. Apostaría a que muchos de los que creen en la homeopatía, astrología y un montón de cosas del estilo se burlarían de vosotros.
Pero resulta... que ellos también creen en la magia.

lunes, 24 de mayo de 2010

Nanofactorías y nanobots de ADN

La nanotecnología molecular permitiría construir objetos (de cualquier tamaño, de nanorobots microscópicos hasta un cohete) con precisión atómica, átomo a átomo.
Algo así se podría hacer en una nanofactoría, donde habría una serie de ensambladores, en una cadena de ensamblaje.
Uno de los objetivos finales, seria conseguir una nanofactoría programable mediante un programa de diseño asistido por ordenador, y capaz de usar una variedad grande de elementos químicos, entre ellos de especial importancia el carbono, pudiéndose fabricar objetos de características superiores de diamante.
Pero para llegar a eso, hay una ruta tecnológica en la se darían una serie de incrementos. La nanotecnología de ADN es una importante parte de esa ruta, gracias a la programabilidad del ADN, y la posibilidad de construir estructuras a partir de este, y a la vez manipular otras estructuras o componentes.

Seria de esperar por tanto que antes de conseguir esa nanofactoría tan buscada , desarrollásemos una nanofactoría primitiva de ADN.

Hace unos días un grupo de investigadores anuncio la creación de la primera cadena de ensamblaje basada en al nanotecnología de ADN. Este descubrimiento pasa desapercibido entre otros a menos que se sea conciente de la importancia de la ruta que se esta siguiendo hasta obtener nanotecnología molecular(MNT)

La cadena de ensamblaje tiene tres componentes principales, todos ellos de ADN:
- Ttres ‘cassettes’, donadores de carga programables.
- Un ‘andador’ que es capaz de moverse y recoger la carga de los ‘cassettes’
- Un suelo de origami de ADN que guía al ‘andador’ por una pista.


El andador tiene 4 patas para moverse y tres brazos para coger la carga, todos ellos de hebras de ADN.
Los donadores de carga, que están en serie a un lado, pueden estar en dos estados, PX(se dona carga) o JX2 (no se dona carga), pudiendo donar una particula de oro de 5 nm(C1), una de 10 nm(C3), o un par de 5 nm(C2).
El ‘andador’ se mueve por el origami de ADN, guiado por una pista, y va pasando uno a uno por los donadores, recogiendo las partículas de oro, que se pueden combinar en 8 productos diferentes.

En definitiva tenemos una cadena de montaje sencilla programable, como la de una fabrica de coches, en al que se pueden construir estructuras, , pero en una escala increíblemente pequeña.

Para el 2012 Ned Seeman y sus compañeros pretenden tener una cadena de ensamblaje mas grande, con una gama de productos mas amplia.

A la par, otro grupo ha conseguido que un andador se desplace a través de un origami de ADN hacia un objetivo. El andador en este caso es llamado ‘araña molecular’, y esta compuesta de una proteína(streptavidina) unida a cuatro hebras de ADN, tres de ellas de ADN enzimático, que se une a una secuencia concreta de ADN y la corta. La cuarta solo se une. La araña molecular va desplazándose a través del origami, usando sus patas buscando ciertas secuencias, pegándose, cortando y avanzando, hasta que se encuentra con una secuencia a la que se puede unir, pero no cortar.
Hasta hace poco, un andador así solo podía dar tres pasos, ahora ha realizado 50. Podrían dar cientos o millares.

Uno de los integrantes, Milan Stojanovic, se imagina nanobots hechos de ADN, capaces de moverse por la membrana celular, buscando ciertas señales químicas y liberando algún componente químico.


‘A proximity-based programmable DNA nanoscale assembly line’ de Hongzhou Gu, Jie Chao, Shou-Jun Xiao y Nadrian C. Seeman
Imágenes.

'Molecular robots guided by prescriptive landscapes' de Kyle Lund, Anthony J. Manzo, Nadine Dabby, Nicole Michelotti, Alexander Johnson-Buck, Jeanette Nangreave, Steven Taylor, Renjun Pei, Milan N. Stojanovic, Nils G. Walter, Erik Winfree y Hao

viernes, 14 de mayo de 2010

Cumbre de la longevidad 2009: Bill Andrews

Aquí tenéis otra charla mas de la cumbre de la longevidad 2009.
Bill Andrews nos habla de la importancia de los telomeros en el envejecimiento, y de la investigación que esta llevando acabo para detener, o incluso revertir el envejecimiento.





En el núcleo de nuestras células se encuentran los cromosomas*. Estos en sus extremos tienen una secuencia repetitiva de bases(TTAGGG) llamada telomeros.
En cada duplicación de la célula, el ADN se duplica a su vez, pero las enzimas encargadas de duplicar el ADN son incapaces de copiar el extremo final de este, con lo que en cada replicación los telomeros se acortan.
Esto se ve muy bien con la analogía del obrero y los ladrillos del video; el ADN original es la fila de ladrillos de abajo, el nuevo ADN es la fila de ladrillos de arriba, y el obrero las enzimas que replican el ADN. El obrero al llegar al final de la línea es incapaz de poner el ultimo bloque de ladrillos, puesto que esta encima. Cada línea de ladrillos será cada vez mas corta.. Cuando los telomeros son muy cortos la célula muere, o tiene peligro de entrar en una situación peligrosa(cancer).

Aproximadamente en el momento de nuestra concepción tenemos 15.000 pares de bases en nuestros telomeros, al nacer 10.000 y al morir 5000.
Ese acortamiento de los telomeros con cada replicación impone un limite a la división celular, y por lo tanto un limite a la longevidad, que se supone que esta sobre los 120-125 años.
Se puede coger una célula y mirando la longitud de sus telomeros saber cuantas veces se ha reproducido, igualmente se pueden coger células de una persona y midiendo la longitud de los telomeros, decir con cierta precisión cuantos años tiene y cuantos le quedan de vida, y es cierta precisión, porque no todas las personas nacen con la misma longitud en sus telomeros, ni en todas las personas las células se dividen al mismo ritmo, ni los telomeros se acortan al mismo ritmo. Pero en general, es un reloj bastante bueno para indicar la edad.

Hay ciertos hábitos que aceleran el acortamiento; como el fumar, el beber en exceso y el estrés.
Estudios en centenarios parecen indicar que los telomeros en sus células se acortan mas lentamente. Debido a que sus células producen cierta cantidad de telomerasa.

¿Os habéis preguntado porque no nacemos viejos? Si tu células tiene una edad de 30 años al tener hijos, tus espermatozoides u óvulos que vienen de esas células, tendrían que tener 30 años también, y por lo tanto el embrión resultante seria concebido con una edad celular de 30 años. Tu hijo nacería con 30 años, a su vez su hijo con 60. En tres generaciones todos muertos.
Pero eso no ocurre, nuestras células reproductoras producen telomerasa que se encarga de colocar bases extra al final de los telomeros, alarga los telomeros, es decir rejuvenece las células. Y lo hace muy bien , puesto que venimos reproduciéndonos desde hace millones de años.
Y esto es una gran prueba de que la longevidad indefinida es posible, si unas células han conseguido mantenerse jóvenes durante cientos de millones de años(a través de miles de diferentes generaciones en diferentes individuos) podríamos hacer lo mismo con todas las células de nuestro cuerpo.
Así como las células reproductoras tienen el gen de la telomerasa, el resto de nuestras células también. El problema es que esta desactivado.





Ciertas sustancias se pueden acoplar al ADN inhibiendo la acción de ciertos genes, y eso es lo que ocurre con el gen de la telomerasa en las células de nuestro cuerpo, excepto en las reproductoras.
Encontrar una sustancia que se una a esa sustancia, volviendo a activar el gen, haría que nuestras células recuperasen esa capacidad perdida de producir su propia telomerasa, y así mantenernos jóvenes.
El equipo de Sierra Sciences hace precisamente eso, analizan 4000 sustancias a la semana, comprobando si consiguen activar ese gen. Por ahora están consiguiendo ciertos resultados. Ya han encontrado varias sustancias que lo consiguen, algunas con mas efectividad que otras. Además de efectiva, la sustancia obviamente deberá ser no toxica.

A fecha del 26 de abril estos son los resultados que han conseguido.

As of April 26, 2010: We have screened 227,690 compounds. We have found 764 telomerase inducers. These represent 39 distinct drug families. Most potent compound=12% of goal

We are screening 4,000 compounds per week.


Cultivos de piel que ya mostraban signos de envejecimiento, bajo el efecto de la telomerasa, pasaban de tener una apariencia arrugada y poco elástica a una apariencia joven.





Respecto a la telomerasa hay cierta preocupación por su relación con el cáncer. Las células cancerosas producen telomerasa para alargar indefinidamente su esperanza de vida. Las células cancerosas por lo tanto, igual que las reproductoras tienen una capacidad ilimitada en su numero de divisiones.
Pero hay indicios para pensar que no debemos tener miedo a activar la telomerasa, puesto que parece que lo que ocurre es que las propias células cancerosas son las que producen la telomerasa para sobrevivir, y no la telomerasa la que convierte a las células normales en cancerosas.
También hay sospechas que cuando una célula normal ha llegado a su limite de divisiones, el acortamiento en sus telomeros desestabiliza sus cromosomas, haciéndola propensa a convertirse en cancerosa. Por lo tanto, alargar los telomeros impediría la formación de células cancerosas. Además, las células del sistema inmune serian mas jóvenes y tendrían mas vitalidad, siendo mas efectivas en destruir células cancerosas.

Volveré con mas presentaciones de la Cumbre.
Podéis leer aquí la anterior.

Pagina principal de Sierra Sciences

*Exactamente no, el material genético forma cromosomas solo en el momento de la división.

domingo, 9 de mayo de 2010

Mejor ser un bicho raro que derretirse.


Traducción

‘Frosty’ se ha congelado criogenicamente y va regresar el invierno que viene...
Menudo bicho raro.

Probabilidades de vivir si te entierran: 0%
Probabilidades de vivir si te incineran: 0%

Probabilidades de vivir si te sometes a un proceso de criónica: >0%

Y no tan cercanas al cero, desde mi punto de vista. Realmente mientras el tejido cerebral se conserve siempre habrá alguna posibilidad, y la nanotecnología molecular podría hacer posible revertir ese estado de muerte, igual que ahora se puede reanimar de una parada cardiaca a alguien que de haberla tenido hace décadas le habríamos considerado muerto.
Definitivamente si te pudres o te incineran poco se puede hacer.

Un detalle, en criónica, que no criogénica, se vitrifica(sin formación de cristales de hielo) no se congela.

sábado, 8 de mayo de 2010

Últimos progresos expresando genes de la mitocondria en el núcleo.

La expresión allotopica(AE) se refiere a la estrategia que intenta expresar ciertas proteínas(13) desde el núcleo en vez de desde el genoma mitocondrial, y así evitar ciertas enfermedades relacionadas con las mitocondrias.

Esa estrategia, entre muchas mas, es la que se intentando en SENS para conseguir la longevidad indefinida. Las estrategias de SENS orientadas a solucionar los daños por mutaciones en las mitocondrias se engloban bajo las investigaciones MITOSENS.

El principal problema es que estas proteínas al ser muy hidrofobicas se pliegan antes de entrar en la mitocondria.
Mediante una programa ideado para hacer modelos de la hidrofobicidad de la proteínas, se vio que leves mutaciones en los genes darían proteínas menos hidrofobicas, permitiendo el transporte hasta la mitocondria.
Hasta ahora tres genes, ATPase6, ND4, y ND1, ligeramente mutados habian sido expresados allotopicamente en células humanas, consiguiendo restaurar un defecto en la cadena respiratoria.
Esta vez, por primera vez, se ha conseguido expresar allotopicamente otro gen mitocondrial mas, el Cox2, en una levadura, habiendo sido el gen modificado para disminuir su hidrofobicidad, y consiguiendo restaurar parcialmente la cadena respiratoria defectuosa.

El objetivo es pasar a mamíferos y con el resto de las 13 proteínas.

Para una información mas completa pinchad aquí.


Otro asunto.

Saber predecir la estructura de una proteína a partir de sus aminoácidos, para al final poder saber cuales van ser sus características, en algo importante como podéis sacar de conclusión de la necesidad comentada de saber como se van a comportar esas proteínas mitocondriales de la forma que queremos, y controlar como de hidrofobicas son.

Por lo tanto, si os agrada la idea de que la longevidad indefinida llegue cuanto antes y os beneficie, seria una buena idea dar apoyo a proyectos como Rosetta@home que usan nuestros ordenadores, en el tiempo que no los aprovechamos, para
realizar sus albores. En concreto este intenta predecir la estructura de las proteínas.
Rosetta es uno de los mucho proyectos de BOINC.

Tenéis la lista de proyectos de BOINC aquí.
Aquí podéis seguir el proyecto Rosetta
. Os dejo un video con instrucciones



Además, queda un bonito salvapantallas



Con la creciente potencia de los ordenadores, este es un campo en el que veremos cada vez mas adelantos. Por eso es importante que la ley de Moore no pare, entre otras cosas.

Herschel, formación estelar, materia oscura y las civilizaciones extraterrestres.

Se podría decir que el universo tiene fecha de caducidad. El principal elemento de este, el hidrógeno, es consumido de forma mas ineficiente y rápida cuanto mas masivas son las estrellas que lo contienen. Una estrella de varias masas solares consume parte de su hidrógeno en pocos millones de años, y parte de su masa es desperdiciada en formar una estrella de neutrones o un agujero negro. En cambio una enana roja con una fracción de una masa solar consume tan lentamente su hidrógeno que permanece decenas de miles de millones de años en la secuencia principal.

Si en cada galaxia existiesen unas cuantas civilizaciones extraterrestres, seria lógico pensar que estas decidirían controlar el consumo de hidrógeno en toda la galaxia, para alargar considerablemente la vida y la cantidad de hidrógeno disponible para ellas.
Podrían acumular hidrógeno de alguna forma, para un consumo posterior. Si hiciesen esto veríamos dos consecuencias a lo largo de todas las galaxias:
- Coincidiendo con los últimos miles de millones de años, tiempo en la que posiblemente aparecerían las primeras civilizaciones y en el que se habrían expandido por toda la galaxia(lo harían en apenas un millón de años), veríamos que el nivel de formación de estrellas se reduciría considerablemente, puesto que las civilizaciones extraterrestres robarían el material de construcción principal de la estrellas para acumularlo.
- Como gran parte de este material se acumularía de alguna forma, dejaría de ser visible, pero su acción gravitatoria permanecería. Parecería que en todas las galaxias hay mas masa de la que se ve.

Según la información suministrada recientemente por el telescopio Herschel la formación estelar se ha visto reducida 10-15 veces en los últimos tres mil millones de años, y no se sabe cual es la razón.

Igualmente llevamos años preguntándonos por la materia oscura.

Ambas tendrían su explicación, si existiesen civilizaciones extraterrestres que realizasen desde hace miles de millones de años tal colosal obra de ingeniería galáctica.
No digo que sea así, solo es una idea que no deberíamos descartar a la ligera.

domingo, 2 de mayo de 2010

Sobre Stephen Hawking y los aliens.


Recientemente Stephen Hawking ha realizado ciertas declaraciones sobre la imprudencia de realizar una SETI activa, es decir enviar mensajes en vez de limitarse a escuchar.

Ha dicho lo siguiente.

‘Si los aliens nos visitan, el resultado seria como cuando Colon desembarco en América, lo cual no termino muy bien para los nativos americanos’

‘Tales civilizaciones avanzadas podrían haberse convertido quizás en nómadas, buscando conquistar y colonizar cualquier planeta que puedan encontrar'.


Si hay algo que tienen seguro los extraterrestres es Superinteligencia Artificial y nanotecnología molecular.

Vayamos por partes.

Los recursos que hay en la Tierra son una infinitesimal parte de los que hay en el resto del sistema solar. No hay nada especial en la Tierra, ni especia ni unobtanio. Todo lo que se encuentra en la Tierra se encuentra de sobra tanto en el resto de nuestro sistema solar, como en el resto de los sistemas solares vecinos.
Es mas la nanotecnología molecular convertiría en recursos de alto valor, recursos considerados como residuos por nosotros. Se podría sustituir los metales por materiales superiores unidos por enlaces covalentes como carbono o silicio. El silicio es uno de los elementos mas abundante tanto en nuestro sistema solar como en el resto.

Sigamos, hablemos de singularidad tecnológica.
Se habla mucho del riesgo de que una superinteligencia artificial nacida en la singularidad tecnológica nos destruyese, no porque tenga aversión hacia nosotros, podría hacerlo sintiendo una total indiferencia hacia nosotros, o incluso amándonos.
Pongamos el caso en el que Bill Gates en su compañía crea una SIA, y la programa para que priorice estas dos cosas:
-Primero y por encima de todo buscar el bien de la humanidad.
-Segundo, buscar el bien de Bill Gates.
Entonces la SIA empieza a utilizar todos los recursos de la Tierra y des pues del sistema solar, destruyendo a todos los seres humanos, para crear billones de clones de Bill. Después se expande a lo largo de la galaxia formando una burbuja expansiva a un pequeño porcentaje de c, destruyendo todas las civilizaciones alienígenas, a la vez que crea cuatrillones de clones de Bill.
Técnicamente estaría buscando el bien de la humanidad, puesto que esta aumentando su población de miles de millones a cuatrillones, y la esta dispersando fuera de la Tierra a toda la galaxia, y a la vez esta buscando el bien de Bill. Solo esta el detalle de que la humanidad esta compuesta de cuatrillones de clones de Bill, aunque para la SIA es un detalle sin importancia. Y lo hizo amándonos. Es solo un ejemplo.


Así pues reflexionemos sobre este asunto, si una superinteligencia nos destruye,¿qué aptitud tendrá esta después hacia civilizaciones alienígenas con las que se encuentre?¿correrían el mismo destino que nosotros? Si han surgido miles de civilizaciones alienígenas en la galaxia,¿cuál es la probabilidad de que alguna de ellas haya dado mal el paso en su singularidad tecnológica, y haya creado una superinteligencia peligrosa? Una entre mil podría ser una amenaza grave.
De hecho si una SIA peligrosa como esta se expandiese por toda la galaxia, colonizando sistemáticamente absolutamente cada uno de los sistemas solares de la galaxia, solo necesitaría unos pocos millones de años para hacerlo. De poco serviría intentar ocultarnos o hacernos publicidad. Podrían llegar a nuestro sistema y empezar a construir una esfera de Dyson, ignorándonos, mientras nos quedamos sin luz solar y morimos todos, sin poder defendernos.
Algo así no ha pasado, así que o en toda la galaxia no ha nacido una SIA peligrosa, o no ha sobrevivido, o las motivaciones de una SIA así estas tan fuera de nuestra compresión, podría ser que aun siendo potencialmente peligrosa en un principio evolucionase de tal forma que no necesitase expandirse por la galaxia, y así el peligro desaparecería. Caso seria en el que esta SIA al buscar el máximo rendimiento, optimizaría tanto en la miniaturización de sus componentes que llegase a una escala tan pequeña como la de los agujeros negros, y por lo tanto desaparecería físicamente. Algo parecido a los alienígenas de ‘Odisea en el espacio’.

Pero pongamos el caso de que estas SIA se expanden por la galaxia. si nacen de muchas civilización alienígenas SIA, ¿que harán cuando se encuentren ambas SIA?. Podría pasar que una civilización postsingularidad con SIA amistosa se encuentre con una civilización postsingularidad con una SIA peligrosa que elimino a sus creadores, o que se encuentren dos que eliminaron a sus creadores. Si el encuentro puede resultar peligroso, una de esas superinteligencias podría valorar que es mejor destruir cualquier civilización alienígena que este a punto de dar su propia singularidad, y así eliminar posibles amenazas por SIA no amistosas. O esperar a ver como da el paso.
El hablar de que una civilización que coloniza el universo obligatoriamente debe haber cambiado para ser pacifica no tendría mucho sentido. Esa SIA por definición no seria violenta ni agresiva consigo misma de forma que le supusiese un problema a la hora de sobrevivir. Lo de la civilización alienígena obligatoriamente pacifica ha sido un argumento de Paul Davies en respuesta a los argumentos de Hawking. Creo que el también se equivoca.

Si una SIA peligrosa pudiese ser un peligro para las demás, tal como he comentado arriba, el resto podría decidir que es conveniente investigar absolutamente toda la galaxia, para vigilar que ninguna civilización tecnológica en sus comienzos pueda dar una SIA peligrosa. A un modesto 10% llegarían a toda la galaxia en un millón de años. Por lo tanto podrían estar aquí desde hace cientos de millones de años o incluso miles de millones de años. Solo necesitarían dejar una pequeña sonda de unos pocos metros, indetectable en una orbita alrededor de la Tierra o en la misma Luna, esperando a ver a que tipo de singularidad tecnológica llegamos, y si creamos algo peligroso destruirnos si es necesario. Esa sonda podría tener un dispositivo grey goo.

Parece que vamos a alcanzar la singularidad en algunas décadas, así que si están esperando poco podríamos haber hecho para ocultarnos o para hacernos publicidad, habrían buscado sistemáticamente en cada rincón de la galaxia.
Y esta es la conclusión final, que cualquier cosa que hagamos será inútil respecto a lo que harán los alienígenas con nosotros.
La vida ha colonizado cada rincón de la Tierra, ya es hora de ayudarla a colonizar todo el sistema solar.